Safra kesesindeki taşların nasıl oluştuğuna dair bilim adamları pek çok araştırma yapmışlardır. Safra kesesinde çok yüksek oranda kolesterol ya da bilirubin olduğu, safra kesesinin tamamen boşalamadığı veya yetersiz boşalma olduğu durumlarda oluştuğuna dair kanıtlar elde edilmiştir. Bu dengesizliklerin sebebi ise kesin olarak bilinmemektedir. Bununla birlikte, pigment taşlarının karaciğer sirozu, safra yolu enfeksiyonları veya orak hücreli anemi gibi kalıtsal kan bozukluğu hastalıkları olan bireylerde daha sık rastlandığı bilinmektedir. Bir kez safra kesesi taşı oluştuğunda, diğer taşların da gelişimi için zemin hazırlanır ve yeni taşların gelişimi indüklenmiş olur.

Safra kesesi taşlarının gelişiminde etkili olan bazı faktörler bilinmektedir. Bu faktörler ise şunlardır;
Mekanizma kişiden kişiye değişebilir; genetik yatkınlık ve yaşam tarzı birlikte rol oynar.